Kubernetes / Linux Note / 运维笔记

Kubernetes Longhorn 分布式存储平台 

Einic Yeo · 2月20日 · 2022年 · · · · ·

今天我们为大家介绍的是 Rancher 开源的一款 Kubernetes 的云原生分布式块存储方案 – Longhorn,Longhorn 是一个轻量级且功能强大的云原生 Kubernetes 分布式存储平台,可以在任意基础设施上运行,Longhorn 还可以与 Rancher 结合使用,将帮助你在 Kubernetes 环境中轻松、快速和可靠地部署高可用性持久化块存储。

使用 Longhorn,可以:

  • 使用 Longhorn 卷作为 Kubernetes 集群中分布式有状态应用程序的持久存储
  • 将你的块存储分区为 Longho版权声明:本文遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,若要转载请务必附上原文出处链接及本声明,谢谢合作!rn 卷,以便你可以在有版权声明:本文遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,若要转载请务必附上原文出处链接及本声明,谢谢合作!或没有云提供商的情况下使用 Kubernetes 卷
  • 跨多个节点和数据中心复制块存储以提高可用性
  • 将备份数据存储在 NFS 或 AWS S3 等外部存储中
  • 创建跨集群灾难恢复卷,以便可以从第二个 Kubernetes 集群中的备份中快速恢复主 Kubernetes 集群中的数据
  • 调度一个卷的快照,并将备份调度到 NFS 或 S3 兼容的二级存储
  • 从备份还原卷
  • 不中断持久卷的情况下升级 Longhorn

Longhorn 还带有独立的 UI,可以使用 Helm、kubectl 或 Rancher 应用程序目录进行安装。

一、架构

Longhorn 为每个卷创建一个专用的存储控制器,并在多个节点上存储的多个副本之间同步复制该卷。Longhorn 在整体上分为两层:数据平面和控制平面,Longhorn Engine 是存储控制器,对应数据平面,Longhorn Manager 对应控制平面。

Longhorn Manager 会以 DaemonSet 的形式在 Longhorn 集群中的每个节点上运行,它负责在 Kubernetes 集群中创建和管理卷,并处理来自 UI 或 Kubernetes 卷插件的 API 调用,它是遵循 Kubernetes 控制器模式。

Longhorn Manager 通过与 Kubernetes APIServer 通信来创建新的 Longhorn volume CRD,然后 Longhorn Manager 会一直 Watch APIServer 的响应,当它看到发现创建了一个新的 Longhorn volume CRD 时,Longhorn Manager 就会去创建一个新的对应卷。当 Longhorn Manager 被要求创建一个卷时,它会在卷所连接的节点上创建一个 Longhorn Engine 实例,并在每个将放置副本的节点上创建一个副本,副本应放置在不同的主机上以确保最大可用性。副本的多条数据路径确保了 Longhorn 卷的高可用性,即使某个副本或引擎出现问题,也不会影响所有副本或 Pod 对卷的访问。

Longhorn Engine 始终与使用 Longhorn 卷的 Pod 在同一节点中运行,它在存储在多个节点上的多个副本之间同步复制卷。

如下图所示,描述了 Longhorn 卷、Longhorn Engine、副本实例和磁盘之间的读/写数据流:

卷、Longhorn Engine、副本实例和磁盘之间的读/写数据流
  • 上图中有3个 Longhorn 卷实例
  • 每个卷都有一个专用控制器,称为 Longhorn Engine,并作为 Linux 进程运行
  • 每个 Longhorn 卷有两个副本,每个副本也是一个 Linux 进程
  • 图中的箭头表示卷、控制器实例、副本实例和磁盘之间的读/写数据流
  • 通过为每个卷创建单独的 Longhorn Engine,如果一个控制器发生故障,其他卷的功能不会受到影响

注意: 图中的 Engine 并非是单独的一个 Pod,而是每一个 Volume 会对应一个 golang exec 出来的 Linux 进程

在 Longhorn 中,每个 Engine 只需要服务一个卷,简化了存储控制器的设计,由于控制器软件的故障域与单个卷隔离,因此控制器崩溃只会影响一个卷。由于 Longhorn Engine 足够简单和轻便,因此我们可以创建多达 100000 个独立的 Engine,Kubernetes 去调度这些独立的 Engine,从一组共享的磁盘中提取资源,并与 Longhorn 合作形成一个弹性的分布式块存储系统。

因为每个卷都有自己的控制器,所以每个卷的控制器和副本实例也可以升级,而不会导致 IO 操作明显中断。Longhorn 可以创建一个长时间运行的 job 任务来协调所有卷的升级,而不会中断系统的运行。

Longhorn 是通过 CSI 驱动在 Kubernetes 中管理的,CSI 驱动通过调用 Longhorn 来创建卷,为 Kubernetes 版权声明:本文遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,若要转载请务必附上原文出处链接及本声明,谢谢合作!工作负载创建持久性数据,CSI 插件可以让我们创建、删除、附加、分离、挂载卷,并对卷进行快照操作,Kubernetes 集群内部使用 CSI 接口与Longhorn CSI 驱动进行通信,而 Longhorn CSI 驱动是通过使用 Longhorn API 与 Longhorn Manager 进行通信。

此外 Longhorn 还提供一个 UI 界面程序,通过 Longhorn API 与 Longhorn Manager 进行交互,通过 Longhorn UI 可以管理快照、备份、节点和磁盘等,此外,集群工作节点的空间使用情况还可以通过 Longhorn UI 查看。

二、安装

要在 Kubernetes 集群上安装 Longhorn,需要集群的每个节点都必须满足以下要求:

  • 与 Kubernetes 兼容的容器运行时(Docker v1.13+、containerd v1.3.7+ 等)
  • Kubernetes v1.18+
  • 安装 open-iscsi,并且 iscsid 守护程序在所有节点上运行,这是必要的,因为 Longhorn 依赖主机上的 iscsiadm 为 Kubernetes 提供持久卷
  • RWX 支持需要每个节点上都安装 NFSv4 客户端
  • 宿主机文件系版权声明:本文遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,若要转载请务必附上原文出处链接及本声明,谢谢合作!统支持 file extents 功能来存储数据,目前我们支持:ext4 与 X版权声明:本文遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,若要转载请务必附上原文出处链接及本声明,谢谢合作!FS
  • bash、curl、findmnt、grep、awk、blkid、lsblk 等工具必须安装
  • Mount propagation 必须启用,它允许将一个容器挂载的卷与同一 pod 中的其他容器共享,甚至可以与同一节点上的其他 pod 共享

Longhorn workloads 必须能够以 root 身份运行才能正确部署和操作 Longhorn。

2.1、依赖

为了验证这些环境要求,Longhorn 官方提供了一个脚本来帮助我们进行检查,执行该脚本需要在本地安装 jq 工具,执行下面的命令即可运行脚本:

➜ curl -sSfL https://raw.githubusercontent.com/longhorn/longhorn/v1.2.3/scripts/environment_check.sh | bash
daemonset.apps/longhorn-environment-check created
waiting for pods to become ready (0/2)
waiting for pods to become ready (0/2)
all pods ready (2/2)

  MountPropagation is enabled!

cleaning up...
daemonset.apps "longhorn-environment-check" deleted
clean up complete

如果没有检查通过会给出相关的提示信息。

要安装 open-iscsi,可以直接使用下面的命令即可:

# apt-get install open-iscsi  # Debian 和 Ubuntu 系统命令
➜ yum install -y iscsi-initiator-utils

Longhorn 官方还为我们还提供了一个 iscsi 安装程序,可以更轻松地自动安装 open-iscsi

➜ kubectl apply -f https://raw.githubusercontent.com/longhorn/longhorn/v1.2.3/deploy/prerequisite/longhorn-iscsi-installation.yaml

部署完成后,运行以下命令来检查安装程序的 pod 状态:

➜ kubectl get pod | grep longhorn-iscsi-installation
longhorn-iscsi-installation-49hd7   1/1     Running   0          21m
longhorn-iscsi-installation-pzb7r   1/1     Running   0          39m

也可以通过以下命令查看日志,查看安装结果:

➜ kubectl logs longhorn-iscsi-installation-pzb7r -c iscsi-installation
...
Installed:
  iscsi-initiator-utils.x86_64 0:6.2.0.874-7.amzn2

Dependency Installed:
  iscsi-initiator-utils-iscsiuio.x86_64 0:6.2.0.874-7.amzn2

Complete!
Created symlink from /etc/systemd/system/multi-user.target.wants/iscsid.service to /usr/lib/systemd/system/iscsid.service.
iscsi install successfully

同样要安装 NFSv4 客户端,可以直接使用下面的命令一键安装:

# apt-get install nfs-common  #  Debian 和 Ubuntu 系统命令
➜ yum install nfs-utils

同样 Longhorn 官方也提供了一个 nfs 客户端安装程序,可以更轻松地自动安装 nfs-client:

➜ kubectl apply -f https://raw.githubusercontent.com/longhorn/longhorn/v1.2.3/deploy/prerequisite/longhorn-nfs-installation.yaml

部署完成后,运行以下命令来检查安装程序的 pod 状态:

➜ kubectl get pod | grep longhorn-nfs-installation
NAME                                  READY   STATUS    RESTARTS   AGE
longhorn-nfs-installation-t2v9v   1/1     Running   0          143m
longhorn-nfs-installation-7nphm   1/1     Running   0          143m

也可以通过以下命令查看日志,查看安装结果:

➜ kubectl logs longhorn-nfs-installation-t2v9v -c nfs-installation
...
nfs install successfully

相关依赖环境准备好过后就可以开始安装 Longhorn 了。

2.2、部署

官方支持使用 Rancher Catalog 应用、kubectl 与 helm 三种方式来进行安装,同样这里我们选择使用 helm 进行安装。

首先添加 longhorn 的 chart 仓库:

➜ helm repo add longhorn https://charts.longhorn.io
➜ helm repo update

然后可以根据自己的实际场景定制 values 文件,可以通过下面的命令获取默认的 values 文件:

➜ curl -Lo values.yaml https://raw.githubusercontent.com/longhorn/charts/master/charts/longhorn/values.yaml

然后可以修改 values 文件中的配置,longhorn 推荐单独挂盘作为存储使用,这里作为测试直接使用默认的 /var/lib/longhorn 目录。

如下所示默认配置的示例片段:

defaultSettings:
  backupTarget: s3://backupbucket@us-east-1/backupstore
  backupTargetCredentialSecret: minio-secret
  createDefaultDiskLabeledNodes: true
  defaultDataPath: /var/lib/longhorn-example/
  replicaSoftAntiAffinity: false
  storageOverProvisioningPercentage: 600
  storageMinimalAvailablePercentage: 15
  upgradeChecker: false
  defaultReplicaCount: 2
  defaultDataLocality: disabled
  guaranteedEngineCPU:
  defaultLonghornStaticStorageClass: longhorn-static-example
  backupstorePollInterval: 500
  taintToleration: key1=value1:NoSchedule; key2:NoExecute
  systemManagedComponentsNodeSelector: "label-key1:label-value1"
  priority-class: high-priority
  autoSalvage: false
  disableSchedulingOnCordonedNode: false
  replicaZoneSoftAntiAffinity: false
  volumeAttachmentRecoveryPolicy: never
  nodeDownPodDeletionPolicy: do-nothing
  mkfsExt4Parameters: -O ^64bit,^metadata_csum
  guaranteed-engine-manager-cpu: 15
  guaranteed-replica-manager-cpu: 15

ingress:  # 开启ingress
  enabled: true
  ingressClassName: nginx  # 配置 ingressclass
  host: longhorn.k8s.local
  annotations: # 添加annotations
    nginx.ingress.kubernetes.io/proxy-body-size: 10000m
enablePSP: false

然后执行下面的命令一键安装 Longhorn:

➜ helm upgrade --install longhorn longhorn/longhorn --namespace longhorn-system --create-namespace -f values.yaml
NAME: longhorn
LAST DEPLOYED: Sun Feb 20 16:14:05 2022
NAMESPACE: longhorn-system
STATUS: deployed
REVISION: 1
TEST SUITE: None
NOTES:
Longhorn is now installed on the cluster!

Please wait a few minutes for other Longhorn components such as CSI deployments, Engine Images, and Instance Managers to be initialized.

Visit our documentation at https://longhorn.io/docs/

部署后可以查看 Pod 的运行状态来确保安装正确:

➜ kubectl get pods -n longhorn-system
NAME                                        READY   STATUS    RESTARTS   AGE
csi-attacher-5f46994f7-fqntq                1/1     Running   0          33s
csi-attacher-5f46994f7-ltxg8                1/1     Running   0          36m
csi-attacher-5f46994f7-vw75d                1/1     Running   0          36m
csi-provisioner-6ccbfbf86f-bvc99            1/1     Running   0          33s
csi-provisioner-6ccbfbf86f-k46hn            1/1     Running   0          36m
csi-provisioner-6ccbfbf86f-lxm8h            1/1     Running   0          36m
csi-resizer-6dd8bd4c97-52gmm                1/1     Running   0          35m
csi-resizer-6dd8bd4c97-9btj6                1/1     Running   0          3s
csi-resizer-6dd8bd4c97-fdjmp                1/1     Running   0          35m
csi-snapshotter-86f65d8bc-5mjk2             1/1     Running   0          33s
csi-snapshotter-86f65d8bc-5rrfs             1/1     Running   0          35m
csi-snapshotter-86f65d8bc-bg6nv             1/1     Running   0          35m
engine-image-ei-fa2dfbf0-jrb2d              1/1     Running   0          36m
engine-image-ei-fa2dfbf0-m5799              1/1     Running   0          36m
instance-manager-e-051171e6                 1/1     Running   0          36m
instance-manager-e-db94b4b7                 1/1     Running   0          24m
instance-manager-r-dd84ad5c                 1/1     Running   0          36m
instance-manager-r-f5eefb8a                 1/1     Running   0          24m
longhorn-csi-plugin-mljt2                   2/2     Running   0          35m
longhorn-csi-plugin-rfzcj                   2/2     Running   0          24m
longhorn-driver-deployer-6db849975f-dh4p4   1/1     Running   0          58m
longhorn-manager-bxks6                      1/1     Running   0          24m
longhorn-manager-tj58k                      1/1     Running   0          2m50s
longhorn-ui-6f547c964-k56xr                 1/1     Running   0          58m

由于上面安装的时候我们添加了 Ingress 支持,所以可以通过配置的域名去访问 Longhorn UI:

➜ kubectl get ingress  -n longhorn-system
NAME               CLASS   HOSTS                ADDRESS         PORTS   AGE
longhorn-ingress   nginx   longhorn.k8s.local   192.168.31.31   80      4m11s

这里我们使用的 ingress-nginx 这个控制器,安装完成后在浏览器中直接访问http://longhorn.k8s.local即可:

Longhorn UI 界面中展示了当前存储系统的状态,也可以在页面中进行其他相关配置。

此外还会创建一个默认的 StorageClass 对象:

➜ kubectl get sc longhorn
NAME                 PROVISIONER          RECLAIMPOLICY   VOLUMEBINDINGMODE   ALLOWVOLUMEEXPANSION   AGE
longhorn (default)   driver.longhorn.io   Delete          Immediate           true                   91m
➜ kubectl get sc longhorn -o yaml
allowVolumeExpansion: true
apiVersion: storage.k8s.io/v1
kind: StorageClass
metadata:
  annotations:
    ......
    storageclass.kubernetes.io/is-default-class: "true"
  creationTimestamp: "2022-02-20T09:32:51Z"
  ......
  name: longhorn
  resourceVersion: "4524911"
  uid: 6066e858-e7ab-4dab-95db-7ff829e6e01b
parameters:
  fromBackup: ""
  fsType: ext4
  numberOfReplicas: "3"
  staleReplicaTimeout: "30"
provisioner: driver.longhorn.io
reclaimPolicy: Delete
volumeBindingMode: Immediate

三、测试

下面我们来测试使用 longhorn 提供一个存储卷,由于提供了默认的 StorageClass,所以直接创建 PVC 即可,创建一个如下所示的 PVC:

apiVersion: v1
kind: PersistentVolumeClaim
metadata:
  name: mysql-pvc
spec:
  storageClassName: longhorn
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  resources:
    requests:
      storage: 1Gi

然后部署一个 mysql 应用来使用上面的 PVC 进行数据持久化:

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: mysql
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: mysql
  strategy:
    type: Recreate
  template:
    metadata:
      labels:
        app: mysql
    spec:
      containers:
      - image: mysql:5.6
        name: mysql
        env:
        - name: MYSQL_ROOT_PASSWORD
          value: password
        ports:
        - containerPort: 3306
          name: mysql
        volumeMounts:
        - name: data
          mountPath: /var/lib/mysql
      volumes:
      - name: data
        persistentVolumeClaim:
          claimName: mysql-pvc

直接创建上面的资源对象:

➜ kubectl get pvc mysql-pvc
NAME        STATUS   VOLUME                                     CAPACITY   ACCESS MODES   STORAGECLASS   AGE
mysql-pvc   Bound    pvc-ec17a7e4-7bb4-4456-9380-353db3ed4307   1Gi        RWO            longhorn       8s
➜ kubectl get pods
NAME                     READY   STATUS    RESTARTS      AGE
mysql-6879698bd4-r8cxz   1/1     Running   0             3m10s
➜ kubectl exec -it mysql-6879698bd4-r8cxz -- mysql -uroot -ppassword
Warning: Using a password on the command line interface can be insecure.
Welcome to the MySQL monitor.  Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 1
Server version: 5.6.51 MySQL Community Server (GPL)

Copyright (c) 2000, 2021, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.

Oracle is a registered trademark of Oracle Corporation and/or its
affiliates. Other names may be trademarks of their respective
owners.

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.

mysql> create database longhorn;
Query OK, 1 row affected (0.01 sec)

mysql>

应用启动成功后我们可以去节点上查看数据来验证是否成功:

➜ ls /var/lib/longhorn/
engine-binaries  longhorn-disk.cfg  replicas
➜ ls /var/lib/longhorn/replicas/
pvc-ec17a7e4-7bb4-4456-9380-353db3ed4307-c40376c5
➜ ls /var/lib/longhorn/replicas/pvc-ec17a7e4-7bb4-4456-9380-353db3ed4307-c40376c5
revision.counter  volume-head-000.img  volume-head-000.img.meta  volume.meta

需要注意的是 longhorn 是分布式块存储,与分布式文件系统不同,不能超过 pv 设置的存储大小(上例中为1G)。我们在数据库中创建了一个名为 longhorn 的数据库,然后我们重建 Pod 再次查看数据是否依然存在:

➜ kubectl get pods
NAME                     READY   STATUS    RESTARTS      AGE
mysql-6879698bd4-s8tfv   1/1     Running   0             6s
➜  kubectl exec -it mysql-6879698bd4-s8tfv -- mysql -uroot -ppassword
Warning: Using a password on the command line interface can be insecure.
Welcome to the MySQL monitor.  Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 1
Server version: 5.6.51 MySQL Community Server (GPL)

Copyright (c) 2000, 2021, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.

Oracle is a registered trademark of Oracle Corporation and/or its
affiliates. Other names may be trademarks of their respective
owners.

Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.

mysql> show databases;
+---------------------+
| Database            |
+---------------------+
| information_schema  |
| longhorn            |
| #mysql50#lost+found |
| mysql               |
| performance_schema  |
+---------------------+
5 rows in set (0.00 sec)

mysql>

可以看到前面创建的数据库依然存在,证明我们的数据持久化成功了。在 Longhorn UI 界面中也可以看到数据卷的信息:

0 条回应